El 15 de septiembre de 1548, se casó en Valladolid con el archiduque Maximiliano, su primo carnal y futuro emperador, que por entonces ya se titulaba rey de Bohemia aunque no sería coronado hasta 1562. Los nuevos esposos fueron regentes de los reinos de España desde ese mismo año hasta 1551, por la ausencia del emperador y del príncipe Felipe. Después de que este volviese a asumir la regencia, los archiduques marcharon en 1552 a Viena, dónde estaba la corte de su suegro y tío Fernando.
Poco a poco, Maximiliano va adquiriendo los títulos de su padre siendo nombrado rey de Bohemia y rey de los Romanos desde 1562, rey de Hungría desde 1563 y, finalmente, emperador del Sacro Imperio Romano Germánico desde la muerte de su padre 1564 hasta su propia muerte en 1576. María era una católica devota, teniendo problemas conyugales por la ambigüedad de su esposo. Tuvo gran influencia sobre sus hijos, entre ellos los emperadores Rodolfo II y Matías.
maría de austria
El 11 de enero de 1552, con diecisiete años, se casó por poderes en Toro con su primo hermano, el príncipe heredero de Portugal, Juan Manuel de Portugal, que contaba solamente con quince años.1 Este matrimonio fue crucial para la historia de los dos países ibéricos, dentro de la política de España de acercamiento a Portugal, supuso el motivo suficiente para la subida al trono portugués de Felipe II (como Felipe I de Portugal) y que Portugal fuera regida por la Casa de Austria en unión dinástica. A fines de noviembre de 1552 llegó a la corte lusitana. Juan de Portugal murió de tuberculosis el 2 de enero de 1554. Juana estba embarazada de.l futuro heredero
JUANA DE
AUSTRIA