A travers ses romans, elle évoque indirectement sa vie personnelle comme dans La femme aux pieds nus qui est un hommage à sa mère.
En 2012, elle écrit son premier roman , Notre Dame du Nil. Il connaît un franc succès. A travers ce récit, elle fait connaître cet événement tragique aux générations futures. Elle obtient le Prix Renaudot pour ce livre.
Le dernier livre de Mukasonga à ce jour est Coeur Tambour, publié en 2016